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Comparaison de réseaux de gènes pour explorer le rôle des transcrits anti-sens

Résumé : Un des problèmes clés en bioinformatique est de comprendre les mé-canismes de régulation au sein d’une cellule. Notre travail concerne l’étude desréseaux de gènes chez le pommier, avec la particularité d’y intégrer les acteursencore mal connus que sont les ARN anti-sens. Pour explorer l’impact des trans-crits anti-sens, nous proposons ici la comparaison des deux réseaux obtenus parune méthode d’inférence très conservative. Nous pouvons ainsi étudier les in-teractions directes entre les gènes qui sont modifiées si l’on fait intervenir lestranscrits anti-sens dans la méthode d’inférence. Un ensemble de motifs caracté-ristiques autour de ces modifications permet de révéler des ensembles d’acteurssens et anti-sens intéressants.
Type de document :
Communication dans un congrès
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https://hal.univ-angers.fr/hal-02516463
Contributeur : Okina Université d'Angers <>
Soumis le : lundi 23 mars 2020 - 21:36:31
Dernière modification le : mercredi 25 mars 2020 - 01:40:25

Fichier

atelier_egc16.pdf
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Identifiants

  • HAL Id : hal-02516463, version 1
  • OKINA : ua15215

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Citation

Marc Legeay, Béatrice Duval. Comparaison de réseaux de gènes pour explorer le rôle des transcrits anti-sens. Grands Graphes et Bioinformatique - Atelier de la 16ème Conférence Internationale Francophone sur l'Extraction et la Gestion des Connaissances (EGC'16), Jan 2016, Reims, France. ⟨hal-02516463⟩

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