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Collected mass spectrometry data on monoterpene indole alkaloids from natural product chemistry research
E. Ramos
1
Pierre Le Pogam
2
Charlotte Fox Alcover
Elvis Otogo N'nang
Gaëla Cauchie
Hazrina Hazni
Khalijah Awang
3
Dimitri Bréard
4
Antonio Echavarren
Michel Frederich
5
Thomas Gaslonde
6
Marion Girardot
7
Raphäel Grougnet
8
Mariia Kirillova
Marina Kritsanida
8
Christelle Lémus
Anne-Marie Le Ray
4
Guy Lewin
Marc Litaudon
3
Lengo Mambu
9
Sylvie Michel
10
Fedor Miloserdov
Michael Muratore
Pascal Richomme
4
Fanny Roussi
3
Laurent Evanno
11
Erwan Poupon
11
Pierre Champy
12
Mehdi Beniddir
Antonio M Echavarren
Auteur
Michel Frederich 5
Auteur
Thomas Gaslonde 6
Auteur
Marion Girardot 7
Auteur
Raphäel Grougnet 8
Auteur
Mariia S Kirillova
Auteur
Marina Kritsanida 8
Auteur
Christelle Lémus
Auteur
Sylvie Michel 10
Auteur
Fedor M Miloserdov
Auteur
Michael E Muratore
Auteur
Pascal Richomme 4
Auteur Etablissement employeur : Substances d'Origine Naturelle et Analogues Structuraux
Mehdi Beniddir
Auteur
1
IRFU - Institut de Recherches sur les lois Fondamentales de l'Univers (CEA Saclay
F-91191 Gif sur Yvette cedex - France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DRF/IRFU (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
2
UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France)
- UNIV-RENNES - Université de Rennes (France)
3
ICSN - Institut de Chimie des Substances Naturelles (Avenue de la terrasse 91198 Gif sur yvette cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UPR2301 (France)
4
SONAS - Substances d'Origine Naturelle et Analogues Structuraux (Université d'Angers, SONAS - Campus du Végétal, 42 Rue Georges Morel - 49070 Beaucouzé - France)
- UA - Université d'Angers : EA921 (Université d'Angers - 40 Rue de Rennes, BP 73532 - 49035 Angers CEDEX 01 - France)
5
Université de Liège (Place du 20-Août, 7 4000 Liège - Belgique)
6
SSMIP - Synthèse et structure de molécules d'interet pharmacologique (Faculté de Pharmacie 4, Avenue de l'Observatoire 75250 PARIS CEDEX 05 - France)
- UPD5 - Université Paris Descartes - Paris 5 (12, rue de l'École de Médecine - 75270 Paris cedex 06 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8638 (France)
7
MDE - Microbiologie de l'Eau (Bâtiment B36 – B37 PBS/IBMIG
1 rue Georges Bonnet
TSA 51106
F-86073 POITIERS Cedex 9 - France)
- EBI - Ecologie et biologie des interactions (Bât. Biologie/Géologie 1er étage 40 Av du recteur Pineau 86022 POITIERS CEDEX - France)
- Université de Poitiers (15, rue de l'Hôtel Dieu - 86034 Poitiers Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7267 (France)
8
COMETE - UMR 8638 - Chimie Organique, Médicinale et Extractive et Toxicologie Expérimentale (4 Av de l'Observatoire 75270 PARIS CEDEX 06 - France)
- UPD5 - Université Paris Descartes - Paris 5 : UMR 8638 (12, rue de l'École de Médecine - 75270 Paris cedex 06 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 8638 (France)
9
PEIRENE - PEIRENE (Faculté des Sciences et Techniques
123 Avenue Albert Thomas
87060 LIMOGES Cedex - France - )
- GEIST - Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique : EA7500 (Université de Limoges - Faculté de Médecine - 2 rue du Dr Marcland 87025 Limoges cedex - France)
- UNILIM - Université de Limoges (33 rue François Mitterrand BP23204 87032 Limoges - France)
10
IRGO - Institut de Recherche en Gestion des Organisations (Pôle Universitaire de Sciences de Gestion - Bâtiment C UFR 400 - 35 avenue Abadie - 33072 Bordeaux - France)
- Université Montesquieu - Bordeaux 4 : EA4190 (Avenue Léon Duguit - 33608 Pessac cedex - France)
- Institut d'Administration des Entreprises (IAE) - Bordeaux (France)
12
UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
Abstract : this Data Descriptor announces the submission to public repositories of the monoterpene indole alkaloid database (MIADB), a cumulative collection of 172 tandem mass spectrometry (MS/MS) spectra from multiple research projects conducted in eight natural product chemistry laboratories since the 1960s. All data have been annotated and organized to promote reuse by the community. Being a unique collection of these complex natural products, these data can be used to guide the dereplication and targeting of new related monoterpene indole alkaloids within complex mixtures when applying computer-based approaches, such as molecular networking. Each spectrum has its own accession number from CCMSLIB00004679916 to CCMSLIB00004680087 on the GNPS. The MIADB is available for download from MetaboLights under the identifier: MTBLS142 (https://www.ebi.ac.uk/metabolights/ MTBLS142).
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Contributeur : Anne-Marie Le Ray <>
Soumis le : lundi 8 juin 2020 - 17:48:32
Dernière modification le : mercredi 16 septembre 2020 - 17:16:57
Contributeur : Anne-Marie Le Ray <>
Soumis le : lundi 8 juin 2020 - 17:48:32
Dernière modification le : mercredi 16 septembre 2020 - 17:16:57
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Licence
Distributed under a Creative Commons Paternité 4.0 International License
Identifiants
- HAL Id : hal-02861053, version 1
- DOI : 10.1038/s41597-019-0028-3
Collections
UNIV-ANGERS | UNIV-POITIERS | UNILIM | ICSN | UNIV-RENNES1 | CEA | SONAS | CEA-UPSAY | DSM-IRFU | INC-CNRS | UNIV-RENNES | GEIST | PEIRENE | UNIV-PARIS-SACLAY | CNRS | UNIV-PARIS5 | CEA-DRF | USPC | UNIV-PARIS
Citation
E. Ramos, Pierre Le Pogam, Charlotte Fox Alcover, Elvis Otogo N'nang, Gaëla Cauchie, et al.. Collected mass spectrometry data on monoterpene indole alkaloids from natural product chemistry research. Scientific Data , Nature Publishing Group, 2019, 6 (15), pp.1-6. ⟨10.1038/s41597-019-0028-3⟩. ⟨hal-02861053⟩
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