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Collected mass spectrometry data on monoterpene indole alkaloids from natural product chemistry research

E. Ramos 1 Pierre Le Pogam 2 Charlotte Fox Alcover Elvis Otogo N'Nang Gaëla Cauchie Hazrina Hazni Khalijah Awang 3 Dimitri Bréard 4 Antonio Echavarren Michel Frederich 5 Thomas Gaslonde 6 Marion Girardot 7 Raphäel Grougnet 8 Mariia Kirillova Marina Kritsanida 8 Christelle Lémus Anne-Marie Le Ray 4 Guy Lewin Marc Litaudon 3 Lengo Mambu 9 Sylvie Michel 10 Fedor Miloserdov Michael Muratore Pascal Richomme 4 Fanny Roussi 3 Laurent Evanno 11 Erwan Poupon 11 Pierre Champy 12 Mehdi Beniddir
1 IRFU - Institut de Recherches sur les lois Fondamentales de l'Univers
2 UR1 - Université de Rennes 1
3 ICSN - Institut de Chimie des Substances Naturelles
4 SONAS - Substances d'Origine Naturelle et Analogues Structuraux
5 Université de Liège
6 SSMIP - Synthèse et structure de molécules d'interet pharmacologique
7 MDE - Microbiologie de l'Eau
EBI - Ecologie et biologie des interactions
8 COMETE - UMR 8638 - Chimie Organique, Médicinale et Extractive et Toxicologie Expérimentale
9 PEIRENE - PEIRENE
10 IRGO - Institut de Recherche en Gestion des Organisations
11 Équipe “Pharmacognosie-Chimie des Substances Naturelles” BioCIS
12 UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11
Abstract : this Data Descriptor announces the submission to public repositories of the monoterpene indole alkaloid database (MIADB), a cumulative collection of 172 tandem mass spectrometry (MS/MS) spectra from multiple research projects conducted in eight natural product chemistry laboratories since the 1960s. All data have been annotated and organized to promote reuse by the community. Being a unique collection of these complex natural products, these data can be used to guide the dereplication and targeting of new related monoterpene indole alkaloids within complex mixtures when applying computer-based approaches, such as molecular networking. Each spectrum has its own accession number from CCMSLIB00004679916 to CCMSLIB00004680087 on the GNPS. The MIADB is available for download from MetaboLights under the identifier: MTBLS142 (https://www.ebi.ac.uk/metabolights/ MTBLS142).
Type de document :
Article dans une revue
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https://hal.univ-angers.fr/hal-02861053
Contributeur : Anne-Marie Le Ray Connectez-vous pour contacter le contributeur
Soumis le : lundi 8 juin 2020 - 17:48:32
Dernière modification le : samedi 26 mars 2022 - 04:23:40

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Citation

E. Ramos, Pierre Le Pogam, Charlotte Fox Alcover, Elvis Otogo N'Nang, Gaëla Cauchie, et al.. Collected mass spectrometry data on monoterpene indole alkaloids from natural product chemistry research. Scientific Data , Nature Publishing Group, 2019, 6 (15), pp.1-6. ⟨10.1038/s41597-019-0028-3⟩. ⟨hal-02861053⟩

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