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Rapport (rapport de recherche)

Improvevement of Fitch function for Maximum Parsimony in Phylogenetic Reconstruction with Intel AVX2 assembler instructions

Abstract : The Maximum Parsimony problem aims at reconstructing a phylogenetic tree from DNA,RNA or protein sequences while minimizing the number of evolutionary changes. Muchwork has been devoted by the Computer Science community to solve this NP-complete prob-lem and many techniques have been used or designed in order todecrease the computationtime necessary to obtain an acceptable solution. In this paper we report an improvement of theevaluation of the Fitch function for Maximum Parsimony using AVX2 assembler instructionof IntelTMprocessors.
Type de document :
Rapport (rapport de recherche)
Liste complète des métadonnées

https://hal.univ-angers.fr/hal-03256210
Contributeur : Okina Univ Angers Connectez-vous pour contacter le contributeur
Soumis le : jeudi 10 juin 2021 - 10:28:17
Dernière modification le : lundi 14 novembre 2022 - 02:42:07
Archivage à long terme le : : samedi 11 septembre 2021 - 18:21:35

Fichier

tr20130624-1.pdf
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Identifiants

  • HAL Id : hal-03256210, version 1
  • OKINA : ua4858

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Citation

Jean-Michel Richer. Improvevement of Fitch function for Maximum Parsimony in Phylogenetic Reconstruction with Intel AVX2 assembler instructions. [Research Report] Non spécifié. 2013, pp.7. ⟨hal-03256210⟩

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