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Algorithm-based prediction of HIV-1 subtype D coreceptor use

Abstract :

We compared the coreceptor tropism-predicting performance of a specific genotypic algorithm for HIV-1 subtype D and that of the geno2pheno algorithm with different cutoffs. The D-specific algorithm and geno2pheno with a false-positivity rate cutoff of 2.5% had the same concordance with the phenotypic determination. The geno2pheno algorithm with a false-positivity rate cutoff of 2.5%, more sensitive but slightly less specific, seems to be an appropriate alternative.

Type de document :
Article dans une revue
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https://hal.univ-angers.fr/hal-03269741
Contributeur : Okina Univ Angers Connectez-vous pour contacter le contributeur
Soumis le : jeudi 24 juin 2021 - 11:35:09
Dernière modification le : lundi 28 mars 2022 - 16:58:03

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Citation

Julia Dina, Stephanie Raymond, Anne Maillard, Hélène Le Guillou-Guillemette, Audrey Rodalec, et al.. Algorithm-based prediction of HIV-1 subtype D coreceptor use. Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2013, 51 (7), pp.3087-3089. ⟨10.1128/JCM.00798-13⟩. ⟨hal-03269741⟩

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