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Selecting a multiplex PCR panel for accurate molecular diagnosis of intestinal protists: a comparative study of Allplex ® (Seegene ® ), G-DiaParaTrio (Diagenode ® ), and RIDA ® GENE (R-Biopharm ® ) assays and microscopic examination

Résumé : Des panels commerciaux de tests PCR multiplex ont été développés pour dépasser les limites de l’examen microscopique pour l’examen parasitologique des selles. Cependant, compte tenu de l’offre croissante de cette approche diagnostique, ces tests doivent être évalués pour les positionner dans un algorithme de diagnostic. Les performances analytiques des tests PCR multiplex G-DiaParaTrio, Allplex ® GI parasite et RIDA ® GENE parasitic stool panel pour la détection de Blastocystis sp., Entamoeba histolytica , Giardia duodenalis , Cryptosporidium spp., Dientamoeba fragilis et Cyclospora cayetanensis , ont été évaluées à travers une étude comparative rétrospective sur 184 échantillons de selles envoyés initialement pour un examen parasitologique. La méthode composite de référence pour le diagnostic parasitologique était l’observation microscopique et la détection d’adhérence spécifique d’ Entamoeba histolytica lorsque cela était nécessaire. Des tests PCR multiplex ont été effectués sur l’ADN extrait de chaque selle conformément aux recommandations du fabricant. Les résultats discordants avec la méthode de référence composite ont été étudiés par PCR spécifique d’espèce pour approcher un diagnostic parasitologique final. La sensibilité/spécificité globale des tests PCR multiplex est respectivement de 93,2 %/100 % pour G-DiaParaTrio, 96,5 %/98,3 % pour Allplex ® GI et 89,6 %/98,3 % pour RIDA ® GENE alors que la méthode de référence composite présente une sensibilité/spécificité globale de 59,6 %/99,8 %. Ces résultats ont confirmé la valeur diagnostique ajoutée de l’approche PCR multiplex pour les protistes gastro-intestinaux. Néanmoins, la procédure de PCR et les performances analytiques pour chaque protiste d’intérêt, variables selon les tests PCR multiplex, doivent être prises en compte lors de la mise en œuvre d’une approche de diagnostic basée sur la PCR.
Type de document :
Article dans une revue
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https://hal.univ-angers.fr/hal-03572136
Contributeur : Nathalie Clement Connectez-vous pour contacter le contributeur
Soumis le : lundi 14 février 2022 - 10:28:28
Dernière modification le : mardi 15 mars 2022 - 15:58:02

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Nicolas Argy, Céline Nourrisson, Ahmed Aboubacar, Philippe Poirier, Stéphane Valot, et al.. Selecting a multiplex PCR panel for accurate molecular diagnosis of intestinal protists: a comparative study of Allplex ® (Seegene ® ), G-DiaParaTrio (Diagenode ® ), and RIDA ® GENE (R-Biopharm ® ) assays and microscopic examination. Parasite, EDP Sciences, 2022, 29, pp.5. ⟨10.1051/parasite/2022003⟩. ⟨hal-03572136⟩

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